2021
  • prof. RNDr. Radim Blaheta, CSc., Ústav geoniky AV ČR (in memoriam)
2020
  • RNDr. Martin Markl, DrSc., Matematický ústav AV ČR
2019
  • Ing. František Matúš, CSc., Ústav teorie informace a automatizace AV ČR (in memoriam)
2018
  • prof. RNDr. Miloslav Feistauer, DrSc., dr. h. c., Matematicko-fyzikální fakulta UK
  • prof. RNDr. Antonín Novotný, CSc., Université de Toulon, Francie
2017
  • prof. Samuel R. Buss, Department of Mathematics, University of California, USA 
  • prof. RNDr. Eduard Feireisl, DrSc., Matematický ústav AV ČR
2016
  • doc. RNDr. Marián Fabian, DrSc., Matematický ústav AV ČR
  • prof. RNDr. Vladimír Müller, DrSc., Matematický ústav AV ČR
2015

V tomto roce nebyla medaile Bernarda Bolzana za zásluhy v matematických vědách udělena.

2014
  • RNDr. Pavel Krejčí, CSc., Matematický ústav AV ČR
2013
  • prof. RNDr. Pavel Drábek, DrSc., Katedra matematiky, Fakulty aplikovaných věd, Západočeská univerzita v Plzni
  • Dr. Jaroslav Kautský, Flinders University of South Australia, Austrálie
  • prof. RNDr. Vladimír Souček, DrSc., Matematicko-fyzikální fakulta UK
  • prof. Ing. Zdeněk Strakoš, DrSc., Ústav informatiky AV ČR
2012
  • prof. Gilles Godefroy, Institut de Mathématiques de Jussieu, Francie
  • prof. RNDr. Michal Křížek, DrSc., Matematický ústav AV ČR
2011
  • prof. RNDr. Vojtěch Rödl, CSc., Emory University, Georgia, USA
  • Ivo Vrkoč, DrSc., Matematický ústav AV ČR
2010
  • RNDr. Věra Kůrková, DrSc., Ústav informatiky AV ČR
  • Ing. Igor Vajda, DrSc., Ústav teorie informace a automatizace AV ČR (in memoriam)
2009

V tomto roce nebyla medaile Bernarda Bolzana za zásluhy v matematických vědách udělena.

2008
  • prof. Stephen A. Cook, FRS, University of Toronto, Kanada
2007
  • doc. Ing. Jiří V. Outrata, DrSc., Ústav teorie informace a automatizace AV ČR
  • prof. Dr. Pekka Neittaanmäki, University of Jyväskylä, Finsko
  • prof. Dr. David Preiss, University of Warwick, Velká Británie
2006
  • prof. Imre Csiszár, DrSc., Maďarská akademie věd, Maďarsko
  • prof. Ivan Kiguradze, A. Razmadze Mathematical Institute Tbilisi, Gruzie
  • prof. Flemming Topsøe, Ph.D., University of Copenhagen, Dánsko
2005
  • prof. RNDr. Radek Mesiar, CSc., Stavebná fakulta STU, Slovenská republika
  • prof. RNDr. Jaroslav Peregrin, CSc., Filozofický ústav AV ČR
2004
  • prof. Owe Axelsson, University of Nijmegen, Nizozemí
  • prof. RNDr. Ivan Netuka, DrSc., Matematický ústav UK v Praze
  • prof. Christopher C. Paige, McGill University, Kanada
2003
  • prof. RNDr. Jozef Gruska, DrSc., Fakulta informatiky Masarykovy univerzity v Brně
  • prof. Rudolf Haněk, Ph.D., Institute of Public Health, University of Cambridge, Velká Británie
  • prof. Josef Kittler, Ph.D., University of Surrey, Velká Británie
2002

V tomto roce nebyla medaile Bernarda Bolzana za zásluhy v matematických vědách udělena.

2001
  • prof. Dr. Qun Lin
  • RNDr. Pavel Pudlák, DrSc.
  • prof. Dana S. Scott
2000
  • prof. RNDr. Petr Hájek, DrSc.
1999
  • prof. Jan van Leeuven
  • prof. Jan van Bemmel
  • RNDr. Jan Pelant, DrSc.
1998
  • prof. David E. Edmunds
  • prof. Dr. Friedrich Liese
  • prof. László Lovász
  • prof. Edward C. van der Meulen
  • prof. RNDr. Beloslav Riečan, DrSc.
1997
  • prof. RNDr. František Neuman, DrSc.
  • prof. Gaisi Takeuti
  • prof. Anne Greenbaum
  • prof. Lotfi A. Zadeh
1996
  • prof. Dr. Ing. Ivo Babuška, DrSc.
  • prof. Moshé Flato, DSc.
1995
  • Ing. Ivan Hlaváček, DrSc.